OrphAnalytics, d’abord écrite Orph’Analytics durant la préparation de la fondation, est un nom valise construit par la fusion des mots Orphan et Analytics après l’abandon d’une des deux syllabes redondantes « an ».

Le logo décrit symboliquement le savoir-faire de l’entreprise en se distinguant des logos actuels par l’emploi d’une police de caractère à empattement (sérif) Times utilisée abondamment dans l’édition. Le choix de cette police évoque les textes imprimés qui peuvent être soumis à l’analyse des services d’OrphAnalytics.

Analytics qui évoque un savoir-faire algorithmique est en rouge dynamique. Orph est en bleu passif. Cerclé avec le rouge An et par une ellipse qui illustre la détection des deux éléments orphelins (OrphAn) par les logiciels d’OrphAnalytics.

Motto pour le métier de l’entreprise : to track down orphan sequences.